整形修剪是获得花椒高产、优质的主要措施之一。花椒是喜光树种，发枝力很强，容易造成树冠稠密，内膛光照不良， 合理整形修剪可使骨架牢固、层次分明、枝条健壮、配备合理、光照足、通风好。既可提高产量，又可延长树龄。
一、 修剪时期
花椒树修剪时间一般在采收后至次年春季发芽前均可，其中以采椒季节修剪最好。有利于改善光照、条件，提高光合作用机能，积累养分，充实花芽，促进分化和缓和树势，不易萌发徒长枝等。幼树和盛果树宜在秋季； 弱树和盛果树宜在秋季；弱树和老树宜在春季。
二、 花椒整形
花椒树形有自然开心形、 三角形、 丛状形和回头形四种， 经济林主要采用自然开心形。
1、 三角形。
截头后留 3 个分布在 3个方向的主枝， 最好是北、西南、东南各一主枝，基角保持在 60° ~70° ，每个主枝上配4-7个侧枝， 结果枝和结果枝组均匀地分布在主枝两侧。这种树形光照较充足， 树冠也大， 能高产。
2、 丛状形。
栽后截干从根基部萌发出很多枝， 保留 5-6 个主枝后 3-4 年即成形。 这种树形易早丰产， 但因主枝多， 长成大要后枝条拥挤， 光照条件， 若管理跟不上， 树势易衰老。 适于早产密植树园。 我市的椒园基本上是此种树形。
3、 自然开心形。
定干高度 30~40公分， 树高不超过 2 米。定植后于 30 厘米左右处留第一侧枝，4-5 年就可以培养成形。这种树形光照好，能丰产稳产。 定植后， 培养 40 至 60 厘米左右的主干，留主技 3-5 个，基角 50-60 度，每个主枝培养侧枝 2-3个。 现在有的地方开始推行双层开心形（也叫疏层小冠形），树高在2 米左右， 共有两层，共有主枝 5 到 7个，侧枝 10到21个，第一层3到4个主枝， 第二层 2到 3个主枝，层间距 80 公分左右。
三、 修剪方法
1、 幼龄树
掌握整形与结果并重的原则， 栽后第二年均匀保留主枝 5-7 个进行短截。其余枝条不进行短截，疏除密挤枝、细弱枝、 病虫枝，保留强壮枝。
2、 结果树
逐步疏剪多余大枝(一般在采收后进行) ，完成整形工作。对冠内枝条进行细致修剪，以疏为主，疏除病虫枝、交叉枝、 重叠枝、密生枝、徒长枝，为树冠内通风透光创造良好条件。 对结果枝要去强留弱，交错占用空间，做到内外留枝均匀，处处能伸进拳头，便于采收。并结合短截营养枝, 拉出来, 压回去，放出去的办法，即对生长中庸的营养枝先行缓放，结果后回缩成枝组。对有空间生长的旺枝先轻短截， 第二年去强留弱，培养成扶组。
