幼树整形修剪的目的是依据花椒树的生长特性和立地条件，通过人工诱导使花椒幼树形成合理的树形结构。树干形状多采用自然开心形和丛状形。丛状形就是栽后截干，使根颈部抽生较多枝条成丛，或一穴栽植２～３株。全部成活后自然生长成丛状。这种树形的树冠形成快，早丰产，但长成大树后，因主干多，枝条拥挤，光照差，产量下降。根据生产实践花椒树形以自然开心形为好，产量高，果色好，香味浓，果粒大小及成熟期齐。
自然开心形的整形修剪方法：
1．定干 定干高度依据栽培品种、立地条件、栽培方式、栽植密度等不同而不同。立地条件差，栽植密度大，树干宜稍矮，反之，则宜稍高。通常定干高度50～60cm，定干时要求剪口下10～15cm范围内有4个以上的饱满芽。这些芽子分布的部位叫“整形带”。苗木发芽后，要及时抹除整形带以下的芽子，促进整形带内新梢的生长，如果栽植2年生苗木，在整形带内已有分枝的，可适当短截，保留一定长度，培养主枝。
2．第一年修剪 定植的幼树，在肥水管理较好的情况下，一般到6月上中旬，新梢即可长到30～40cm以上，这时可初步选定3--5个主枝。其余新梢全部摘心，控制生长，作为辅养枝。冬季修剪，主要是主枝的选留和辅养枝的处理。主枝间隔15cm左右，且向不同方位生长，使其分布均匀。主枝开张角度宜在35°左右。水平夹角和开张角度不符合要求时，可用拉枝、支撑或剪口芽调整的办法解决，主枝间的长势力求均衡。冬剪时主枝一般保留长度为35～50cm。主枝以外的枝条，凡重叠、交叉、影响主枝生长的从基部疏除，不影响主枝生长的可适当保留，利用其早期结果，待以后再根据情况决定留舍。
3．第二年的修剪 对各主枝的延长枝进行短截，剪留长度为45～50cm：要继续采用强枝短截，弱枝长留的办法，使主枝间均衡生长。如果竞争枝和延长枝长势相差不大时，一般应对竞争枝重短截，过一二年后再从基部剪除。应注意剪口芽的方向，用剪口枝调整主枝的角度和方向。主枝上的第一侧枝距主干30～40cm，侧枝宜选留斜平侧或斜上侧枝。侧枝与主枝的水平夹角以40°左右为宜。各主枝上的第一侧枝，要尽量同向选留，防止互相干扰。对生长健壮的树，夏季修剪主要是控制竞争枝和主侧枝以外的旺枝。控制的方法是，对过旺的竞争枝和直立枝，及早疏除，其余新枝可于6月中下旬摘心或剪截，使其萌发副梢，成为结果枝或结果枝组。
4．第三年的修剪 第三年树冠扩展较快，枝、叶生长量明显增加。整形修剪的任务仍以培养主枝和侧枝为主，选留好主枝上的侧枝，同时注意处理好辅养枝，培养结果枝组。各主枝上的第二侧枝，一般剪留50～60cm。继续控制竞争枝，均衡各主枝的长势。同时注意各主枝的角度和方向，使主枝保持旺盛的长势。各主枝上的第二侧枝，要选在第一侧枝对面，相距25～30cm，最好是斜上侧或斜平侧。第二侧枝的夹角，以45～50°为宜。对于骨干枝以外的枝条，在不影响主枝生长的情况下，应尽量多留，增加树体总生长量，迅速扩大树冠。这一时期，对于辅养枝处理得当与否，对早结果、早丰产影响很大。除疏除过密的长旺枝外，其余枝条均宜轻剪缓放，使其早结果。
