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韩城市大红袍花椒基因组测序结果正式“出炉”

2019-03-15 15:47IP属地 陕西渭南0
   韩城市大红袍花椒基因组测序结果正式“出炉”,实现了花椒超高杂合(杂合率约为4.11%)、超高重复(重复率约93.17%)基因组的高质量组装。据了解,这次花椒基因组测序工作的完成,在全球尚属首例。

 

 

从2015年开始,我市积极与深圳华大基因科技服务有限公司洽谈合作,计划从花椒的基础生物学研究上进行突破,通过新的技术手段来加速改良韩城大红袍花椒的品质。2017年,我市正式与该公司签订合同,实施大红袍花椒基因组的从头组装及群体重测序研究项目。项目共分两部分进行,第一部分进行“大红袍花椒基因组的从头组装和注释”,第二部分进行“花椒群体重测序进化研究”。合同签订后,市花椒局为了满足研究需要,先后在我市、宝鸡凤县、甘肃武都、四川汉源等地采集花椒样本88种共271株,收集记录271株花椒的表型数据,及时将样本送往华大基因进行测序和分析。经过近一年的努力,大红袍花椒基因组测序结果正式“出炉”,为进一步揭示花椒的遗传密码、进化历史、表型等特征提供了保障,也为项目二期花椒分子育种的开展打下了坚实的基础。

 

 

据了解,目前该公司正在按照我市需求,全力构建“全球首个花椒基因组数据库”。数据库建成后将对所有花椒研究人员、种植人员开放,为花椒产品科普、产业发展、推进研究整合提供一个综合平台。

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